82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2683 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  66.67 
 
 
600 aa  825    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  85.25 
 
 
585 aa  1028    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  64.88 
 
 
590 aa  764    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  100 
 
 
608 aa  1236    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  63.16 
 
 
582 aa  771    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  39.41 
 
 
626 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  38.3 
 
 
615 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  36.47 
 
 
566 aa  318  1e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  38.13 
 
 
546 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  32.23 
 
 
544 aa  277  5e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  32.14 
 
 
541 aa  276  7e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  35.81 
 
 
546 aa  272  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  30.44 
 
 
541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  30.59 
 
 
538 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  30.72 
 
 
538 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  29.8 
 
 
538 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  29.72 
 
 
539 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  29.11 
 
 
497 aa  172  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  27.08 
 
 
602 aa  160  7e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.58 
 
 
652 aa  111  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.66 
 
 
649 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.73 
 
 
649 aa  93.6  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.82 
 
 
649 aa  94  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25 
 
 
490 aa  93.6  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.68 
 
 
649 aa  91.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  25.58 
 
 
543 aa  90.9  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.8 
 
 
500 aa  90.1  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  22.42 
 
 
507 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.19 
 
 
483 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.63 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.22 
 
 
476 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.44 
 
 
495 aa  82.8  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  27.24 
 
 
491 aa  81.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  23.51 
 
 
503 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  31.32 
 
 
489 aa  79.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.56 
 
 
489 aa  79.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  28.19 
 
 
491 aa  77.4  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.56 
 
 
483 aa  76.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.62 
 
 
498 aa  76.6  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.24 
 
 
482 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.55 
 
 
494 aa  72.4  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.46 
 
 
484 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.23 
 
 
495 aa  72.8  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.94 
 
 
481 aa  70.9  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.05 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  36.24 
 
 
184 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  22.18 
 
 
606 aa  63.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  31.25 
 
 
172 aa  60.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  26.02 
 
 
227 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  35.07 
 
 
206 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  35.48 
 
 
161 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  23.83 
 
 
509 aa  52.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  33.56 
 
 
155 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  34.04 
 
 
159 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  33.56 
 
 
152 aa  50.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  35.17 
 
 
166 aa  50.8  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  29.46 
 
 
228 aa  50.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  34.64 
 
 
176 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2191  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.49 
 
 
371 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  37.21 
 
 
217 aa  48.9  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  44.94 
 
 
634 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  34.48 
 
 
153 aa  48.9  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  36.96 
 
 
633 aa  48.9  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  30.26 
 
 
156 aa  48.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  20.22 
 
 
522 aa  47.8  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  32.88 
 
 
164 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.72 
 
 
580 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  36.17 
 
 
159 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  36.17 
 
 
159 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  43.55 
 
 
158 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  38.71 
 
 
219 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  43.55 
 
 
159 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  41.79 
 
 
161 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  40.68 
 
 
201 aa  45.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.81 
 
 
367 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  29.89 
 
 
189 aa  44.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.35 
 
 
380 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.35 
 
 
380 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  30.28 
 
 
160 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  40.28 
 
 
159 aa  43.9  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.68 
 
 
379 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.68 
 
 
379 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>