78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0956 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
626 aa  1280    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  56.21 
 
 
615 aa  739    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  41.23 
 
 
582 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  43.86 
 
 
566 aa  444  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  39.57 
 
 
600 aa  422  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  40.76 
 
 
585 aa  414  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  38.46 
 
 
590 aa  402  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  38.96 
 
 
608 aa  399  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  37.77 
 
 
546 aa  345  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  36.93 
 
 
546 aa  319  7.999999999999999e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  36.6 
 
 
541 aa  318  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  35.63 
 
 
544 aa  317  5e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  33.76 
 
 
541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  30.58 
 
 
497 aa  208  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  31.9 
 
 
539 aa  203  9e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  30.02 
 
 
538 aa  193  7e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  29.52 
 
 
538 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  29.41 
 
 
538 aa  190  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  28.27 
 
 
602 aa  179  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.86 
 
 
652 aa  110  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.59 
 
 
649 aa  106  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.85 
 
 
649 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  27.24 
 
 
507 aa  104  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.65 
 
 
649 aa  102  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.86 
 
 
649 aa  101  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  27.3 
 
 
543 aa  97.4  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  27.94 
 
 
491 aa  87.4  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.78 
 
 
483 aa  87.4  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  33.13 
 
 
491 aa  86.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.19 
 
 
483 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.22 
 
 
489 aa  86.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  25.77 
 
 
503 aa  84.3  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.99 
 
 
481 aa  83.2  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25 
 
 
490 aa  82  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.72 
 
 
482 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.35 
 
 
489 aa  80.9  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.06 
 
 
484 aa  80.9  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  31.1 
 
 
495 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.77 
 
 
498 aa  79  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.48 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.02 
 
 
476 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  25.56 
 
 
606 aa  74.7  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.16 
 
 
500 aa  72.8  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  40.65 
 
 
159 aa  72.4  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  27.83 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.85 
 
 
494 aa  69.3  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.78 
 
 
494 aa  69.3  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.74 
 
 
495 aa  68.6  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  28.64 
 
 
219 aa  67  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  31.85 
 
 
217 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  34.85 
 
 
201 aa  63.9  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  24.88 
 
 
228 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  33.1 
 
 
152 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  35.76 
 
 
184 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  36.11 
 
 
166 aa  59.7  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  30.37 
 
 
206 aa  57.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  32.41 
 
 
155 aa  56.2  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.33 
 
 
580 aa  54.7  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  31.13 
 
 
156 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  31.58 
 
 
160 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.88 
 
 
240 aa  53.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  38.04 
 
 
634 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1279  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.89 
 
 
252 aa  50.8  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  26.62 
 
 
172 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  31.15 
 
 
633 aa  50.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  33.33 
 
 
161 aa  49.7  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  41.94 
 
 
159 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  41.94 
 
 
159 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  30.34 
 
 
164 aa  48.5  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  37.1 
 
 
158 aa  48.1  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  36.84 
 
 
159 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  40.32 
 
 
159 aa  47.8  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  23.18 
 
 
522 aa  47.8  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  29.37 
 
 
164 aa  47  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  37.21 
 
 
466 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  28.03 
 
 
161 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  37.5 
 
 
160 aa  45.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  29.6 
 
 
151 aa  45.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>