61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1830 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  59.37 
 
 		 544 aa  663    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  60.59 
 
 		 546 aa  651    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  100 
 
 		 541 aa  1113    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  51.95 
 
 		 546 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  51.38 
 
 		 541 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  32.95 
 
 		 615 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  36.6 
 
 		 626 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.17 
 
 		 582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  38.45 
 
 		 566 aa  296  9e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  34.56 
 
 		 600 aa  281  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.12 
 
 		 585 aa  281  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.88 
 
 		 608 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  32.94 
 
 		 590 aa  259  7e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  30.98 
 
 		 497 aa  219  7e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  26.17 
 
 		 538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  26.67 
 
 		 538 aa  161  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  26.02 
 
 		 539 aa  159  8e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  25.8 
 
 		 538 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  25.66 
 
 		 602 aa  136  9e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.59 
 
 		 649 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.66 
 
 		 652 aa  100  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.14 
 
 		 649 aa  99.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.18 
 
 		 649 aa  97.1  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.18 
 
 		 649 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.39 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.36 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  24.3 
 
 		 543 aa  72.8  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.57 
 
 		 489 aa  72  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.29 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.48 
 
 		 490 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.22 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  20.21 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.96 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  22.87 
 
 		 606 aa  65.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  28.43 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  30.43 
 
 		 227 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  31.54 
 
 		 206 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  27.17 
 
 		 219 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  29.44 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  20.39 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  26.95 
 
 		 228 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.1 
 
 		 489 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  32.79 
 
 		 217 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  32.62 
 
 		 201 aa  58.9  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  33.06 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.78 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.68 
 
 		 489 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  23.08 
 
 		 507 aa  55.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.29 
 
 		 494 aa  54.3  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  39.22 
 
 		 161 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24 
 
 		 495 aa  54.3  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.31 
 
 		 494 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  35.29 
 
 		 634 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  34.27 
 
 		 184 aa  51.2  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  48.05 
 
 		 159 aa  50.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  33.66 
 
 		 633 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  44.44 
 
 		 466 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  36.72 
 
 		 166 aa  43.5  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36 
 
 		 580 aa  43.5  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>