24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1324 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
240 aa  484  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  60 
 
 
206 aa  261  4.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  62.57 
 
 
201 aa  254  8e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  57.07 
 
 
219 aa  236  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  56.06 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  47.67 
 
 
227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  47.67 
 
 
228 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  31.25 
 
 
541 aa  65.1  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  33.06 
 
 
541 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  33.65 
 
 
566 aa  56.6  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  31.88 
 
 
626 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  28.27 
 
 
544 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  35.71 
 
 
546 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  25.93 
 
 
546 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  27.97 
 
 
615 aa  45.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  32.09 
 
 
590 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  36.84 
 
 
497 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1279  queuine tRNA-ribosyltransferase  22.67 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.48 
 
 
585 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  31.46 
 
 
608 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  35.09 
 
 
538 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  35.71 
 
 
538 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  38.6 
 
 
539 aa  42  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  35.71 
 
 
538 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>