21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1874 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  428  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  65.13 
 
 
201 aa  277  9e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  61.11 
 
 
219 aa  263  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  60 
 
 
240 aa  261  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  59.9 
 
 
217 aa  246  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  41.99 
 
 
228 aa  166  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  41.99 
 
 
227 aa  159  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  32.33 
 
 
541 aa  70.1  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  30.2 
 
 
544 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  31.54 
 
 
541 aa  62.4  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  27.78 
 
 
546 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  30.37 
 
 
626 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.07 
 
 
608 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  30.5 
 
 
546 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  29.29 
 
 
566 aa  55.1  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  29.69 
 
 
615 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  41.94 
 
 
585 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  38.71 
 
 
590 aa  49.3  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  31.53 
 
 
600 aa  48.5  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.67 
 
 
582 aa  46.2  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  40.35 
 
 
497 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>