56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1208 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  100 
 
 		 541 aa  1121    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  56.25 
 
 		 544 aa  598  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  51.38 
 
 		 541 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  47.01 
 
 		 546 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  48.08 
 
 		 546 aa  502  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  33.76 
 
 		 626 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  32.36 
 
 		 615 aa  295  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  34.27 
 
 		 566 aa  281  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  31.35 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  32.72 
 
 		 600 aa  253  6e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.2 
 
 		 585 aa  250  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  30.23 
 
 		 608 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  30.2 
 
 		 590 aa  236  8e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  28.36 
 
 		 497 aa  163  7e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  28.43 
 
 		 602 aa  160  7e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  27.97 
 
 		 538 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  27.97 
 
 		 538 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  27.97 
 
 		 538 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  27.85 
 
 		 539 aa  144  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.97 
 
 		 652 aa  89.7  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.38 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.53 
 
 		 649 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.59 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.37 
 
 		 649 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.76 
 
 		 481 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.51 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  32.33 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  32.59 
 
 		 201 aa  68.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  31.06 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.25 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.11 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.67 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.4 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.97 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  27.82 
 
 		 228 aa  62.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  21.86 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  27.33 
 
 		 227 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  34.51 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.38 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.35 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  29.92 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  47.46 
 
 		 161 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  23.75 
 
 		 543 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  19.65 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.72 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  21.82 
 
 		 606 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  46.67 
 
 		 155 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.96 
 
 		 489 aa  47.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  42.59 
 
 		 151 aa  47.4  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  20.61 
 
 		 498 aa  47  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.41 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  26.74 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.14 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  27.43 
 
 		 491 aa  44.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.88 
 
 		 494 aa  43.9  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  41.82 
 
 		 466 aa  43.5  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>