62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0182 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 161 aa  322  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  58.75 
 
 		 182 aa  183  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  45.62 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  42.86 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  52.07 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  52.89 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  52.89 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  47.15 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  46.25 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  41.98 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  43.95 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  43.71 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  45.91 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  38.99 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  38.36 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  42.5 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  44.03 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  33.12 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  45.76 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  32.68 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  33.13 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  40 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  31.48 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  30.18 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  31.06 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  32.63 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  28.57 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  28.46 
 
 		 253 aa  62  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  31.91 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  31.01 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  33.63 
 
 		 634 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  32.28 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.71 
 
 		 580 aa  54.7  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  34.34 
 
 		 546 aa  54.7  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  26.47 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  34.18 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  39.22 
 
 		 541 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  30.97 
 
 		 633 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  34.91 
 
 		 544 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  47.46 
 
 		 541 aa  53.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  38.95 
 
 		 546 aa  52  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  45.45 
 
 		 600 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  30.25 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  24.64 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  32.65 
 
 		 566 aa  47.4  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  37.97 
 
 		 615 aa  47.4  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  38.46 
 
 		 585 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  28.03 
 
 		 626 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  28.57 
 
 		 472 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  41.79 
 
 		 608 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  26.47 
 
 		 466 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0010  PUA domain-containing protein  36.25 
 
 		 377 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0665  PUA domain-containing protein  38.27 
 
 		 376 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.438806  normal  0.11367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  38.24 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  38.81 
 
 		 582 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  36.76 
 
 		 469 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  38.96 
 
 		 590 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  31.51 
 
 		 606 aa  42  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  29.9 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  35.59 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  32.31 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  27.78 
 
 		 469 aa  40.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>