33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01450 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  507  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  52.08 
 
 
179 aa  160  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  54.4 
 
 
194 aa  149  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  40.56 
 
 
177 aa  138  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  37.87 
 
 
205 aa  116  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  31.11 
 
 
158 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  29.41 
 
 
158 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  33.96 
 
 
151 aa  62.4  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  32.79 
 
 
165 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  32.69 
 
 
159 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  32.69 
 
 
159 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  29.17 
 
 
161 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  31.73 
 
 
159 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  30.65 
 
 
182 aa  56.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  31.73 
 
 
159 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  27.27 
 
 
165 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  29.11 
 
 
155 aa  53.5  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  26.67 
 
 
161 aa  53.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  35.64 
 
 
159 aa  52  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  26.23 
 
 
151 aa  52.4  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  25.53 
 
 
174 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  23.7 
 
 
172 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  25 
 
 
165 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  30 
 
 
160 aa  48.5  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  24.67 
 
 
174 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  25.78 
 
 
165 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  24.63 
 
 
170 aa  46.2  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  29.52 
 
 
168 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  30.56 
 
 
172 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  30.77 
 
 
167 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  28.97 
 
 
159 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  29.63 
 
 
159 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49944  predicted protein  29.75 
 
 
575 aa  42.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.737368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>