64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1050 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  40.61 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  37.65 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  37.95 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  35.33 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  41.03 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  30.12 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  33.6 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  28.74 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  30.54 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  27.54 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  27.65 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  35.29 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  27.11 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  29.17 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  30.18 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  34.34 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  39.29 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  36.36 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  39.29 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  39.29 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  32.67 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  39.51 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  33.64 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  32.17 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  34.18 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  29.7 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  36.9 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.57 
 
 		 580 aa  53.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  24.67 
 
 		 253 aa  48.9  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  36.36 
 
 		 373 aa  48.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  28.71 
 
 		 151 aa  47.8  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  24.76 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  31.08 
 
 		 335 aa  45.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  26.73 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 		 367 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  34.43 
 
 		 380 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  29.17 
 
 		 368 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  32.76 
 
 		 373 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  29.03 
 
 		 371 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  38.46 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  30.77 
 
 		 389 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  29.33 
 
 		 331 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  37.93 
 
 		 367 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  37.93 
 
 		 367 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  38.89 
 
 		 367 aa  42.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  36.49 
 
 		 383 aa  42  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  30.3 
 
 		 466 aa  41.6  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  29.33 
 
 		 331 aa  41.2  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  32.35 
 
 		 379 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  34.43 
 
 		 372 aa  41.2  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  41.07 
 
 		 373 aa  41.2  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  39.66 
 
 		 367 aa  40.8  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  39.66 
 
 		 367 aa  40.8  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  39.66 
 
 		 367 aa  40.8  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  34.21 
 
 		 372 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 		 375 aa  40.8  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  28.74 
 
 		 382 aa  40.8  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  39.66 
 
 		 367 aa  40.8  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  39.66 
 
 		 367 aa  40.8  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  39.66 
 
 		 367 aa  40.8  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  39.66 
 
 		 367 aa  40.8  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  39.66 
 
 		 367 aa  40.8  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  39.66 
 
 		 367 aa  40.8  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>