More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4199 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
389 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  96.92 
 
 
389 aa  750    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  81.38 
 
 
393 aa  617  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  81.3 
 
 
392 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  69.95 
 
 
390 aa  510  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  69.38 
 
 
378 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  69.07 
 
 
378 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  69.07 
 
 
378 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  65.12 
 
 
379 aa  479  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  66.39 
 
 
386 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  66.4 
 
 
373 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  67.49 
 
 
378 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  65.58 
 
 
373 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  64.53 
 
 
379 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  66.22 
 
 
376 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  65.59 
 
 
379 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  65.3 
 
 
377 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  64.5 
 
 
387 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  63.66 
 
 
371 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  65.59 
 
 
376 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  63.1 
 
 
377 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  63.1 
 
 
377 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  66.84 
 
 
376 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  65.68 
 
 
376 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  62.57 
 
 
396 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  63.66 
 
 
385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  60 
 
 
370 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  59.39 
 
 
368 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  59 
 
 
374 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  58.92 
 
 
382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  58.17 
 
 
374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  58.17 
 
 
370 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  58.01 
 
 
368 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  58.86 
 
 
383 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  54.89 
 
 
375 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  59.94 
 
 
368 aa  388  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  52.45 
 
 
373 aa  347  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  52.62 
 
 
380 aa  339  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  56.91 
 
 
377 aa  335  7.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  48.65 
 
 
371 aa  312  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  45.58 
 
 
376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  46.87 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  51.38 
 
 
377 aa  301  9e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  46.09 
 
 
375 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  45.04 
 
 
390 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  45.82 
 
 
372 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 
372 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
372 aa  296  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 
372 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
374 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  47.28 
 
 
372 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  44 
 
 
376 aa  293  5e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  44.89 
 
 
375 aa  292  8e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
376 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  44.23 
 
 
368 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.2 
 
 
390 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  42.27 
 
 
372 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  46.03 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  47.4 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  45.53 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
372 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
372 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  44.02 
 
 
376 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  44.02 
 
 
376 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
372 aa  285  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  45.82 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  45.82 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  45.82 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  45.55 
 
 
372 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 
378 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 
372 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  43.7 
 
 
373 aa  282  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  43.7 
 
 
373 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  44.78 
 
 
378 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
374 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
372 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  43.87 
 
 
373 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44.24 
 
 
374 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
379 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  47.06 
 
 
374 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
374 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  45.01 
 
 
372 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  52.21 
 
 
368 aa  279  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  41.78 
 
 
387 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
372 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  44.32 
 
 
363 aa  277  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3349  glutamate 5-kinase  47.78 
 
 
377 aa  276  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0434084  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  44.12 
 
 
378 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 
380 aa  276  5e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 
372 aa  276  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
374 aa  275  7e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  44.57 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  42.16 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  44.57 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 
370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  43.41 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>