More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2055 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
380 aa  770    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  76.52 
 
 
395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  67.11 
 
 
379 aa  527  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2179  gamma-glutamyl kinase  60.32 
 
 
378 aa  444  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2247  gamma-glutamyl kinase  59.61 
 
 
436 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.353036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  57.03 
 
 
384 aa  431  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
373 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 
373 aa  346  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  48.12 
 
 
376 aa  345  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  45.97 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 
373 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  44.71 
 
 
392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  46.9 
 
 
373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  44.99 
 
 
378 aa  302  6.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  43.97 
 
 
376 aa  301  9e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  46.41 
 
 
377 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  46.74 
 
 
383 aa  298  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  47.22 
 
 
373 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  46.94 
 
 
373 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  40.44 
 
 
372 aa  293  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  44.75 
 
 
373 aa  292  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  45.68 
 
 
374 aa  291  9e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  46.2 
 
 
372 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  42.97 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  42.97 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  45.63 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.56 
 
 
390 aa  280  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  44.6 
 
 
367 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  44.32 
 
 
372 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  43.28 
 
 
372 aa  277  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  41.67 
 
 
376 aa  276  5e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  44.32 
 
 
393 aa  275  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
367 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  38.87 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  43.6 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
372 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  41.02 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 
370 aa  272  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  43.24 
 
 
374 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  45.26 
 
 
375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  42.62 
 
 
372 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  39.29 
 
 
371 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  45.15 
 
 
373 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  42.12 
 
 
367 aa  266  4e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  42.28 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  42.28 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
367 aa  266  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 
374 aa  265  8e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 
363 aa  265  8e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  40.8 
 
 
387 aa  265  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
368 aa  265  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
372 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  40.53 
 
 
375 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  41.89 
 
 
367 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
372 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  44.26 
 
 
376 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  42.15 
 
 
369 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  42.15 
 
 
369 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  41.64 
 
 
374 aa  262  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  44.6 
 
 
372 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 
367 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  39.26 
 
 
393 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 
367 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 
367 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 
367 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  42.13 
 
 
376 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 
367 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 
375 aa  260  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  42.01 
 
 
371 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 
372 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 
372 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 
372 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  44.04 
 
 
372 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  43.32 
 
 
372 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  43.32 
 
 
372 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 
372 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  43.51 
 
 
378 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  42.62 
 
 
372 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  42.7 
 
 
378 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  42.62 
 
 
372 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
372 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  38.54 
 
 
373 aa  255  8e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  39.68 
 
 
369 aa  255  8e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  38.84 
 
 
366 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  42.08 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  41.6 
 
 
382 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  41.03 
 
 
369 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  42.43 
 
 
378 aa  254  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  43.16 
 
 
379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  38.63 
 
 
373 aa  253  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>