37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43572 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  100 
 
 		 177 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  50 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  42.33 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  40.56 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  44.72 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  30.37 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  36.44 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  35.29 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28705  predicted protein  30.48 
 
 		 564 aa  63.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  30.4 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  28.57 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  28.99 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  33.88 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  28.99 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  28.99 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  26.97 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  33.33 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  27.45 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  30.4 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  36.44 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  27.92 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  35 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  31.36 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  25.31 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  34.19 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  34.15 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  28.21 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  27.65 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  24.26 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  30.4 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  25.75 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  26.73 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49944  predicted protein  23.89 
 
 		 575 aa  45.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.737368 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  28.15 
 
 		 155 aa  44.7  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.73 
 
 		 580 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  29.77 
 
 		 152 aa  41.2  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  30.39 
 
 		 481 aa  40.8  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>