46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3058 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 165 aa  333  3.9999999999999995e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  58.54 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  57.58 
 
 		 165 aa  205  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  54.55 
 
 		 165 aa  197  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  53.94 
 
 		 170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  38.36 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  37.65 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  39.2 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  37.18 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  39.47 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  38.6 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  39.87 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  38.6 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  37.34 
 
 		 159 aa  99  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  35.96 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  33.75 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  35.44 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  35.44 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  35 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  35 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  35.83 
 
 		 151 aa  84  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  32.74 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  32.09 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  30.77 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  27.54 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  35.05 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  28.21 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  28.35 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  25.31 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  29.9 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  27.14 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  49.21 
 
 		 393 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  22.11 
 
 		 205 aa  47.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  31.03 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  35.09 
 
 		 385 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  34.21 
 
 		 369 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  29.77 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  27.2 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  41.54 
 
 		 369 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.39 
 
 		 580 aa  43.9  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  31.46 
 
 		 633 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  36.71 
 
 		 371 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  34.83 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28705  predicted protein  25.37 
 
 		 564 aa  42  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  38.2 
 
 		 385 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0665  PUA domain-containing protein  34.52 
 
 		 376 aa  41.2  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.438806  normal  0.11367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>