48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0681 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 172 aa  345  2e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  70.18 
 
 		 172 aa  264  4e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  62.94 
 
 		 174 aa  228  3e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  60.48 
 
 		 168 aa  226  1e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  42.28 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  37.95 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  35.44 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  38.89 
 
 		 165 aa  87.8  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  33.53 
 
 		 170 aa  84.3  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  39.16 
 
 		 165 aa  84  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  31.47 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  33.13 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  31.3 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  37.65 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  37.88 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  31.95 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  29.7 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  34.31 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  32.31 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  32.31 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  28.66 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  30.54 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  32.31 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  27.54 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  30.23 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  34.68 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  26.09 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  27.65 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  33.75 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  29.49 
 
 		 373 aa  51.2  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  37.33 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  28.79 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  27.82 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  23.7 
 
 		 253 aa  45.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  34.15 
 
 		 331 aa  44.7  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  36.11 
 
 		 411 aa  44.7  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  37.31 
 
 		 333 aa  44.7  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.49 
 
 		 580 aa  43.9  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  33.33 
 
 		 331 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  37.5 
 
 		 484 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  38.03 
 
 		 401 aa  42  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  25.2 
 
 		 373 aa  42  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  35.09 
 
 		 368 aa  41.6  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  34.04 
 
 		 388 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  34.72 
 
 		 481 aa  41.2  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  30 
 
 		 393 aa  41.2  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  34.72 
 
 		 503 aa  41.2  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  36.25 
 
 		 385 aa  40.8  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>