More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2580 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 373 aa  752    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  58.33 
 
 		 373 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  56.45 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  57.8 
 
 		 373 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  56.45 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  55.91 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  56.18 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  56.18 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  51.6 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  48.92 
 
 		 376 aa  364  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  47.79 
 
 		 372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 		 378 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  46.09 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  48.82 
 
 		 383 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  48.56 
 
 		 379 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  48.82 
 
 		 383 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  47.44 
 
 		 376 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 		 373 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  47.45 
 
 		 374 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  47.95 
 
 		 367 aa  336  3.9999999999999995e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  48.08 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  47.96 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  49.08 
 
 		 377 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  47.93 
 
 		 393 aa  332  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  46.83 
 
 		 372 aa  331  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  48.12 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  46.72 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  46.41 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  47.76 
 
 		 382 aa  326  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  45.36 
 
 		 373 aa  325  9e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 		 369 aa  324  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  46.03 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  47.57 
 
 		 372 aa  323  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  47.84 
 
 		 378 aa  322  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 		 372 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 		 372 aa  322  6e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  45.58 
 
 		 377 aa  322  9.000000000000001e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  47.58 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  46.83 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  47.58 
 
 		 374 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 		 368 aa  318  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  46.56 
 
 		 374 aa  317  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  45.18 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  44.47 
 
 		 395 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  43.67 
 
 		 373 aa  316  4e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 		 380 aa  316  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  48.65 
 
 		 372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  46.47 
 
 		 372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  46.15 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  47.65 
 
 		 363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  47.03 
 
 		 378 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  45.84 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  46.26 
 
 		 370 aa  312  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 		 372 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  44.44 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  45.24 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  44.96 
 
 		 376 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2179  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  47.3 
 
 		 372 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  44.47 
 
 		 384 aa  308  8e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  44.84 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  44.47 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  47.84 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  44.84 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  47.58 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 		 372 aa  306  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  45.95 
 
 		 374 aa  306  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 		 372 aa  306  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  45.7 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  47.87 
 
 		 380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  43.75 
 
 		 369 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  43.75 
 
 		 369 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  44.93 
 
 		 365 aa  305  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  47.11 
 
 		 372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  44.29 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  46.38 
 
 		 373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  47.03 
 
 		 372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>