80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1989 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  68.02 
 
 		 172 aa  241  3e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  66.07 
 
 		 168 aa  237  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  62.94 
 
 		 172 aa  228  3e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  44.74 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  37.65 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  33.33 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  34.51 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  34.59 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  33.81 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  36.43 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  37.89 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  32.86 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  32.09 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  35 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  35 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  33.83 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  35 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  32.31 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  25.45 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  31.01 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  30.16 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  27.92 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  29.41 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  35.71 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  30.18 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  29.52 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  31.53 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  38.75 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  31.58 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  25.53 
 
 		 253 aa  52.4  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  42.37 
 
 		 378 aa  51.2  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  42.37 
 
 		 378 aa  51.2  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  39.24 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  42.86 
 
 		 373 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  35.44 
 
 		 373 aa  48.5  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  28.1 
 
 		 205 aa  47.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  31.88 
 
 		 382 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  48.89 
 
 		 378 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  35.62 
 
 		 481 aa  45.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  37.1 
 
 		 373 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0068  gamma-glutamyl kinase  34.78 
 
 		 368 aa  45.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  41.82 
 
 		 378 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  30.43 
 
 		 368 aa  44.3  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  29.35 
 
 		 331 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  32.1 
 
 		 372 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  34.33 
 
 		 333 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.27 
 
 		 580 aa  43.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  31.58 
 
 		 372 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  31.58 
 
 		 372 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13030  glutamate 5-kinase  42.37 
 
 		 359 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0917331  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  38.33 
 
 		 374 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  31.58 
 
 		 372 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 		 374 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  29.63 
 
 		 372 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  38.71 
 
 		 401 aa  42.4  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  30.91 
 
 		 371 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  31.58 
 
 		 372 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  31.58 
 
 		 372 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  31.58 
 
 		 394 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  31.58 
 
 		 372 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  35.38 
 
 		 383 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  31.46 
 
 		 368 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0071  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 309 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  32.65 
 
 		 374 aa  42  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  29.13 
 
 		 376 aa  41.6  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  34.25 
 
 		 503 aa  41.6  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  31.94 
 
 		 411 aa  41.6  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  28.33 
 
 		 368 aa  41.6  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  32.84 
 
 		 372 aa  41.6  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  28.09 
 
 		 388 aa  41.6  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  32.73 
 
 		 377 aa  41.6  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  32.84 
 
 		 331 aa  41.6  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  32.73 
 
 		 377 aa  41.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  35.59 
 
 		 372 aa  41.2  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 		 374 aa  41.2  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  26.19 
 
 		 393 aa  41.2  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  38.33 
 
 		 419 aa  41.2  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  35.38 
 
 		 377 aa  41.2  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  31.88 
 
 		 338 aa  40.8  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>