More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2219 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
368 aa  702    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  71.43 
 
 
380 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  60.27 
 
 
377 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  53.72 
 
 
377 aa  324  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  53.59 
 
 
389 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  52.76 
 
 
389 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  54.4 
 
 
386 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  52.34 
 
 
376 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  50.53 
 
 
374 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  52.89 
 
 
378 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
368 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  52.07 
 
 
376 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  50.82 
 
 
385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  53.68 
 
 
382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  53.66 
 
 
383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  51.51 
 
 
374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  51.51 
 
 
370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  52.76 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  51.78 
 
 
379 aa  310  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  51.2 
 
 
377 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  51.2 
 
 
377 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  52.89 
 
 
376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  48.9 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  50.81 
 
 
396 aa  305  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  50.96 
 
 
387 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  51.93 
 
 
393 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  52.94 
 
 
368 aa  305  9.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  51.78 
 
 
379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  53.04 
 
 
378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  53.04 
 
 
378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  50.82 
 
 
371 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  51.1 
 
 
373 aa  299  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  50.83 
 
 
375 aa  299  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  52.62 
 
 
376 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  51.34 
 
 
390 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  51.37 
 
 
373 aa  296  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  51.66 
 
 
378 aa  296  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  49.45 
 
 
370 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  52.47 
 
 
368 aa  280  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  52.45 
 
 
377 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 
372 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  45.21 
 
 
375 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  46.76 
 
 
373 aa  256  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  45.36 
 
 
377 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 
372 aa  253  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  45.9 
 
 
383 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  45.63 
 
 
379 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  45.63 
 
 
383 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  44.93 
 
 
372 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  44.93 
 
 
372 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  41.92 
 
 
373 aa  249  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
372 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  43.24 
 
 
376 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 
372 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 
372 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 
372 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  42.19 
 
 
379 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  42.58 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  41.64 
 
 
376 aa  243  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  42.62 
 
 
376 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  40.82 
 
 
372 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  43.36 
 
 
372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  44.17 
 
 
372 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  35.42 
 
 
373 aa  238  9e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  45.8 
 
 
374 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 
372 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  44.11 
 
 
372 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
372 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  42.66 
 
 
378 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
368 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 
375 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
373 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 
373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  44.75 
 
 
371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 
372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 
372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
374 aa  236  6e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 
372 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  44.17 
 
 
372 aa  235  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  37.43 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
372 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  40.27 
 
 
374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  37.98 
 
 
373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
378 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44.44 
 
 
374 aa  233  6e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
394 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  45.26 
 
 
374 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  41.37 
 
 
378 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
372 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  41.64 
 
 
376 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>