51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1622 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  97.48 
 
 		 159 aa  277  3e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  96.86 
 
 		 159 aa  277  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  84.91 
 
 		 159 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  61.01 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  45.22 
 
 		 161 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  47.5 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  41.72 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  47.9 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  37.34 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  32.5 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  35.44 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  37.5 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  35.19 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  31.87 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  34.32 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  34.78 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  33.33 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  32.12 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  35.15 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  33.56 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  30.32 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  34.13 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  30.43 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  40.21 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  31.33 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  30.11 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  26.7 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  28.99 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  38.46 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  31.73 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  26.9 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  45.59 
 
 		 633 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  30.51 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.15 
 
 		 580 aa  50.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  39.39 
 
 		 566 aa  48.9  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  43.06 
 
 		 546 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  40.32 
 
 		 626 aa  47.4  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  39.44 
 
 		 615 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  36.49 
 
 		 544 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  39.13 
 
 		 634 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  29.1 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  35.06 
 
 		 600 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  43.55 
 
 		 608 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  36.14 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 546 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.93 
 
 		 582 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.36 
 
 		 585 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  28.83 
 
 		 152 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  35.59 
 
 		 541 aa  41.2  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>