50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0310 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  44.74 
 
 		 174 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  44.3 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  47.58 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  42.28 
 
 		 172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  41.03 
 
 		 174 aa  83.6  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  39.81 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  38.54 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  35.9 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  46.25 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  32.33 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  32.68 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  35.9 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  35.04 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  32.19 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  34.09 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  35.2 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  40 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  35.48 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  43.21 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  34.04 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  43.16 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  39.8 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  36.36 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  36.73 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  35.05 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  28.1 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  40 
 
 		 159 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  37.5 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  30.23 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  37.76 
 
 		 167 aa  62  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  26.97 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  26.61 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.71 
 
 		 580 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  38.67 
 
 		 464 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28705  predicted protein  28.26 
 
 		 564 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  43.33 
 
 		 373 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  44.44 
 
 		 544 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  37.93 
 
 		 373 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  31.94 
 
 		 333 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  26.55 
 
 		 377 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  40.58 
 
 		 633 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  30.56 
 
 		 331 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10139  RNA binding protein Ligatin/Tma64, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12570)  29.46 
 
 		 356 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00215023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 469 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  30.77 
 
 		 338 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  30.56 
 
 		 331 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  40.74 
 
 		 546 aa  41.2  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  36.14 
 
 		 371 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  28.95 
 
 		 338 aa  40.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>