34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0193 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 155 aa  320  5e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  47.02 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  30.12 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  28.21 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  32.33 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  30.77 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  28.05 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  34.74 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  35.79 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  35.79 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  35.79 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  28.66 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  32.99 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  25.45 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  27.56 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  31.91 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  34.23 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  25.79 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  28.21 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  31.86 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  29.84 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  22.98 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  30.48 
 
 		 253 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  27.74 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  27.5 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  24.36 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  32.93 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  24.52 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  25 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  27.2 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  22.84 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  34.21 
 
 		 335 aa  45.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  28.15 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  35.9 
 
 		 321 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>