52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0859 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  49.58 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  47.86 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  49.58 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  47.9 
 
 		 159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  46.15 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  38.79 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  37.91 
 
 		 165 aa  97.1  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  43.86 
 
 		 182 aa  92  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  35.29 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  32.03 
 
 		 165 aa  90.1  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  37.09 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  32.68 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  35.53 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  30.07 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  33.96 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  31.13 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  29.14 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  28.1 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  35.48 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  28.57 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.53 
 
 		 580 aa  63.5  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  30.95 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  30.41 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  33.33 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  29.88 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  31.85 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  35.05 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  31.3 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  25.81 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  38.57 
 
 		 633 aa  53.9  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  28.57 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  27.48 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  24.12 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  44.44 
 
 		 544 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  36.84 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  42.59 
 
 		 541 aa  47.4  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  42.59 
 
 		 546 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  42.62 
 
 		 546 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  28.67 
 
 		 626 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  36.49 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  32.47 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  44.44 
 
 		 541 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  37.14 
 
 		 469 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  40.35 
 
 		 615 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  29.47 
 
 		 466 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  38.71 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  38.6 
 
 		 600 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0665  PUA domain-containing protein  33.78 
 
 		 376 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.438806  normal  0.11367 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  32.86 
 
 		 634 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0494  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.76 
 
 		 389 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.201395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  32.43 
 
 		 164 aa  40.4  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>