32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0973 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  100 
 
 		 152 aa  307  4e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  47.02 
 
 		 155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  41.24 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  41.24 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  30.54 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  40.21 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  36.27 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  34.31 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  39.02 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  24.36 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  32.63 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  28.1 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  36.56 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  33.68 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  37.11 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  28.1 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  27.16 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  27.56 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  35.05 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  30.65 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  34.31 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  29.52 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  29.9 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  30.53 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  24.34 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  28.4 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  28.42 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  31.71 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  27.5 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  28.43 
 
 		 321 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  29.77 
 
 		 177 aa  41.2  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  25.83 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>