66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0597 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 168 aa  334  2.9999999999999997e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  66.07 
 
 		 174 aa  237  5e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  64.46 
 
 		 172 aa  231  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  60.48 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  40.61 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  47.58 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  35 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  33.77 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  30.38 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  38.89 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  34.81 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  31.47 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  31.47 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  31.54 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  34.81 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  34.11 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  34.11 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  32.56 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  30.86 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  39.02 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  31.06 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  30.97 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  34.65 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  37.21 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  38.37 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  33.33 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  35.85 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  25.79 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  34.58 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.26 
 
 		 580 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  25.75 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  28.99 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  40.35 
 
 		 378 aa  47.4  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  40.35 
 
 		 378 aa  47.4  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  46.81 
 
 		 378 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  28.57 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0068  gamma-glutamyl kinase  36.23 
 
 		 368 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  29.89 
 
 		 377 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  26.09 
 
 		 371 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  26.56 
 
 		 253 aa  45.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  32.93 
 
 		 372 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  36.62 
 
 		 373 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  33.8 
 
 		 368 aa  45.1  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  26.92 
 
 		 373 aa  45.1  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  36.36 
 
 		 373 aa  45.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.82 
 
 		 333 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  35.38 
 
 		 377 aa  44.7  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  32.93 
 
 		 372 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  32.79 
 
 		 382 aa  44.7  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.82 
 
 		 331 aa  44.3  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  28.4 
 
 		 390 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  37.93 
 
 		 374 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 		 377 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0426  glutamate 5-kinase  35 
 
 		 359 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.776395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  35.38 
 
 		 383 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  37.93 
 
 		 374 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2272  gamma-glutamyl kinase  33.87 
 
 		 370 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 		 393 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0071  tRNA pseudouridine synthase B  35.71 
 
 		 309 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  30.88 
 
 		 331 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  32.26 
 
 		 332 aa  42  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  31.67 
 
 		 372 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  34.18 
 
 		 388 aa  41.6  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  37.5 
 
 		 378 aa  41.6  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  39.29 
 
 		 374 aa  41.2  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  30.14 
 
 		 321 aa  40.8  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>