40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0695 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 158 aa  320  5e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  42.22 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  33.6 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  31.29 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  37.89 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  38.89 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  30.77 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  39.22 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  32.69 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  37.65 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  34.04 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  43.04 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  40 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  38.78 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  40.21 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  38.55 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  33.11 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  29.73 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  37 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  31.11 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  35.29 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  34.17 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  38.46 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  37.5 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  38.46 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  34.62 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  38.46 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  34.94 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  34.31 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  27.88 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  30.17 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  27.74 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  36.84 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  34.44 
 
 		 331 aa  48.1  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  33.33 
 
 		 331 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  33.33 
 
 		 333 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  33.71 
 
 		 328 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  29.89 
 
 		 310 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.86 
 
 		 580 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  31.34 
 
 		 322 aa  40.8  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>