53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0894 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 159 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  99.37 
 
 		 159 aa  310  5.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  97.48 
 
 		 159 aa  278  3e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  84.91 
 
 		 159 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  61.01 
 
 		 158 aa  176  8e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  45.86 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  42.33 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  46.25 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  49.58 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  38.61 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  35 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  36.71 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  37.5 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  33.75 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  35.19 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  34.32 
 
 		 167 aa  97.1  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  34.16 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  32.7 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  32.12 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  33.94 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  30.32 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  32.89 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  31.68 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  34.13 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  41.24 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  31.33 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  27.84 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  30.11 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  37.97 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  28.99 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  32.69 
 
 		 253 aa  61.2  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.59 
 
 		 580 aa  56.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  30.51 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  26.21 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  41.18 
 
 		 633 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  43.06 
 
 		 546 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  37.37 
 
 		 566 aa  49.7  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  41.94 
 
 		 626 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  27.27 
 
 		 634 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  39.44 
 
 		 615 aa  47.4  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  35.06 
 
 		 600 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.17 
 
 		 608 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  37.35 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  34.78 
 
 		 546 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  35.14 
 
 		 544 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  28.36 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  29.37 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  29.27 
 
 		 466 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.93 
 
 		 582 aa  44.7  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.36 
 
 		 585 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  29.73 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28705  predicted protein  24.84 
 
 		 564 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  34.78 
 
 		 184 aa  41.2  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>