33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0148 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  54.55 
 
 		 165 aa  203  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  56.36 
 
 		 170 aa  198  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  54.55 
 
 		 165 aa  197  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  53.94 
 
 		 165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  37.89 
 
 		 182 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  38.22 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  33.12 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  38.69 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  41.59 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  41.59 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  41.59 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  39.82 
 
 		 159 aa  97.8  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  34.57 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  33.12 
 
 		 159 aa  87.4  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  29.56 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  31.72 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  28.12 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  31.47 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  33.81 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  31.47 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  27.98 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  32.69 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  40 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  30.63 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  35.29 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  30.4 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  27.56 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  27.06 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  27.56 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  25.78 
 
 		 253 aa  48.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  29.37 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  25.14 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>