31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16787 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  100 
 
 
205 aa  422  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  43.14 
 
 
179 aa  158  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  42.33 
 
 
177 aa  142  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  37.87 
 
 
253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  44.35 
 
 
194 aa  105  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  35.2 
 
 
151 aa  70.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  29.92 
 
 
158 aa  61.6  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  30.09 
 
 
151 aa  56.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  32.28 
 
 
161 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  26.32 
 
 
182 aa  55.1  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  30.51 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  30.51 
 
 
159 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  30.51 
 
 
159 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  30.17 
 
 
158 aa  52.4  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  31.2 
 
 
160 aa  51.6  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  29.66 
 
 
159 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  22.51 
 
 
170 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  24.68 
 
 
165 aa  49.3  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  28.1 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  31.96 
 
 
161 aa  47.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  22.11 
 
 
165 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  32.79 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  34.38 
 
 
159 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  33.68 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  24.81 
 
 
172 aa  47  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  28.79 
 
 
172 aa  47  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  28.57 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  24.03 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  30.6 
 
 
167 aa  45.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  25.14 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49944  predicted protein  23.22 
 
 
575 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.737368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>