46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0035 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  100 
 
 
160 aa  311  2.9999999999999996e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  66.47 
 
 
167 aa  215  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  68.75 
 
 
159 aa  213  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  68.55 
 
 
159 aa  207  7e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  66.25 
 
 
159 aa  205  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  47.17 
 
 
161 aa  136  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  46.25 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  42.77 
 
 
182 aa  124  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  38.51 
 
 
165 aa  103  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  41.38 
 
 
158 aa  102  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  44.35 
 
 
159 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  44.35 
 
 
159 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  40.74 
 
 
165 aa  100  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  44.35 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  42.61 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  35.44 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  36.25 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  29.56 
 
 
165 aa  87  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  37.6 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  37 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  39.8 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  30.86 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  30.3 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  30.54 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  27.16 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  30.18 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  33.61 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  34.19 
 
 
177 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  34.86 
 
 
633 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  22.98 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  31.2 
 
 
205 aa  51.6  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  39.24 
 
 
174 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  30 
 
 
253 aa  50.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  26.23 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  39.56 
 
 
615 aa  46.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  35.8 
 
 
466 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  42.35 
 
 
469 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  37.5 
 
 
626 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32 
 
 
580 aa  45.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  31.07 
 
 
376 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  37.14 
 
 
546 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  30.91 
 
 
376 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49944  predicted protein  35.9 
 
 
575 aa  42  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.737368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 
368 aa  41.2  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  30.34 
 
 
379 aa  40.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  30.34 
 
 
376 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>