40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0233 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 161 aa  318  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  45.62 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  45.57 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  47.17 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  45 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  45.22 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  40.62 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  43.67 
 
 		 182 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  42.26 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  51.97 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  45.22 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  52.76 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  50.39 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  50.39 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  46.46 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  39.1 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  38.22 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  37.18 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  37.9 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  37.88 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  33.83 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  34.81 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  43.16 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  29.73 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  36.36 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  28.1 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  50.77 
 
 		 633 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  26.39 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  29.7 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  31.33 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  24.26 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  32.93 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  28.93 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  45.83 
 
 		 546 aa  47.8  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  31.96 
 
 		 205 aa  47.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  35.63 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  38.55 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  40 
 
 		 469 aa  41.6  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  40 
 
 		 634 aa  41.2  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  36.27 
 
 		 566 aa  40.4  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>