40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0427 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  100 
 
 		 159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  66.87 
 
 		 167 aa  218  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  64.56 
 
 		 159 aa  211  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  68.55 
 
 		 160 aa  207  7e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  60.76 
 
 		 159 aa  196  7.999999999999999e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  45 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  45.91 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  42.41 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  40.49 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  35.19 
 
 		 165 aa  99  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  35.62 
 
 		 170 aa  94  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  33.75 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  40.35 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  39.47 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  39.47 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  40.35 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  35.34 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  28.12 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  37.09 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  40.21 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  40 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  33.33 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  30.72 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  30.23 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  36.36 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  36.44 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  29.41 
 
 		 174 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  34 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  35.64 
 
 		 253 aa  53.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  36.67 
 
 		 464 aa  50.8  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  24.52 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  46.67 
 
 		 633 aa  48.5  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  28.57 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  32.79 
 
 		 205 aa  47.4  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.25 
 
 		 580 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  27.5 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  40.28 
 
 		 469 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  37.84 
 
 		 472 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  36.26 
 
 		 615 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  32.22 
 
 		 469 aa  42.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>