44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0231 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 165 aa  330  6e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  61.21 
 
 		 165 aa  218  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  58.79 
 
 		 170 aa  209  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  57.58 
 
 		 165 aa  205  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  53.94 
 
 		 165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  41.98 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  43.21 
 
 		 182 aa  124  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  45.22 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  45.05 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  46.9 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  48.67 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  46.9 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  40.49 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  45.13 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  41.36 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  39.38 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  40.74 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  36.31 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  40 
 
 		 151 aa  91.3  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  39.16 
 
 		 172 aa  84  8e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  34.51 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  31.29 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  30.81 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  31.47 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  30.77 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  43.21 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  36.44 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  29.37 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  27.65 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  32.79 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  27.33 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  30.53 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  24.68 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  31.45 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.8 
 
 		 580 aa  47  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  40.58 
 
 		 633 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  39.13 
 
 		 393 aa  44.3  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  37.84 
 
 		 164 aa  43.9  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  29.63 
 
 		 373 aa  43.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  26.96 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  24.77 
 
 		 378 aa  42.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2885  glutamate 5-kinase  28.46 
 
 		 375 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.732421  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  34.83 
 
 		 469 aa  41.6  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  31.58 
 
 		 466 aa  41.2  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>