More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1080 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  100 
 
 
377 aa  753    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  77.3 
 
 
383 aa  587  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  58.7 
 
 
392 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  49.31 
 
 
373 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  51.52 
 
 
373 aa  342  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  46.83 
 
 
390 aa  328  7e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  49.32 
 
 
376 aa  327  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  49.31 
 
 
372 aa  323  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  45.86 
 
 
372 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  45.58 
 
 
373 aa  322  9.000000000000001e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  46.81 
 
 
376 aa  320  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  46.59 
 
 
390 aa  312  4.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  48.48 
 
 
378 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  48.74 
 
 
373 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  42.74 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 
373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  48.74 
 
 
373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  47.11 
 
 
374 aa  305  8.000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  46.78 
 
 
367 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  46.78 
 
 
367 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  48.08 
 
 
372 aa  302  6.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  46.78 
 
 
367 aa  302  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  46.78 
 
 
367 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  46.78 
 
 
367 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  46.78 
 
 
367 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  46.78 
 
 
367 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  46.78 
 
 
367 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  46.78 
 
 
367 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  46.5 
 
 
367 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  48.06 
 
 
370 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  45.18 
 
 
367 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
372 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  48.48 
 
 
371 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
372 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
372 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
372 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
372 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  46.41 
 
 
380 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 
367 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 
367 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 
367 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 
367 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 
367 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  45.48 
 
 
376 aa  298  9e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  48.34 
 
 
377 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.63 
 
 
375 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  46.11 
 
 
369 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
369 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
369 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  46.37 
 
 
379 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  47.54 
 
 
372 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 
384 aa  293  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  46.93 
 
 
363 aa  293  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 
377 aa  292  6e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 
369 aa  292  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  45.38 
 
 
367 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 
372 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  47.27 
 
 
372 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 
372 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 
374 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  44.48 
 
 
395 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 
378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
372 aa  289  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  46.99 
 
 
372 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  45.03 
 
 
393 aa  288  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  47.04 
 
 
383 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 
379 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  47.04 
 
 
383 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 
375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  47.09 
 
 
379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  41.13 
 
 
373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  41.8 
 
 
369 aa  287  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 
374 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
378 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 
372 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 
372 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
373 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  46.05 
 
 
372 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  48.09 
 
 
374 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 
372 aa  285  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 
367 aa  285  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  48.09 
 
 
374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  43.87 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  43.75 
 
 
371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  41.6 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  45.63 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 
368 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  41.13 
 
 
373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  43.8 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  40.59 
 
 
373 aa  282  6.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  45.41 
 
 
385 aa  282  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>