37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1481 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  100 
 
 
159 aa  314  4e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  83.65 
 
 
159 aa  270  8.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  66.25 
 
 
160 aa  205  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  62.42 
 
 
167 aa  199  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  60.76 
 
 
159 aa  196  7.999999999999999e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  45.22 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  43.71 
 
 
182 aa  118  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  44.03 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  41.36 
 
 
165 aa  104  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  39.75 
 
 
165 aa  104  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  39.24 
 
 
170 aa  100  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  37.34 
 
 
165 aa  99  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  33.12 
 
 
165 aa  87.4  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  32.76 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  36.61 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  36.61 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  37.5 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  33.33 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  31.13 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  38.78 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  29.7 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  34.65 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  33.33 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  37.5 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  35.71 
 
 
174 aa  57.4  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  30 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  32.67 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  34.15 
 
 
177 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  34.86 
 
 
633 aa  52.4  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  24.36 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0504341 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  24.34 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  33.68 
 
 
205 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  29.63 
 
 
253 aa  44.7  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  33.78 
 
 
472 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  26.85 
 
 
466 aa  44.3  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  33.87 
 
 
634 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.14 
 
 
580 aa  43.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>