55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1314 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  61.17 
 
 
544 aa  668    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  100 
 
 
546 aa  1123    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  60.59 
 
 
541 aa  663    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  51.2 
 
 
546 aa  553  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  48.18 
 
 
541 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  34.26 
 
 
615 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  34.4 
 
 
626 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  38.18 
 
 
566 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.4 
 
 
582 aa  300  4e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  34.45 
 
 
600 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.71 
 
 
585 aa  267  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.89 
 
 
608 aa  266  5.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  32.17 
 
 
590 aa  259  6e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0923  PUA domain containing protein  31.7 
 
 
497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  28.97 
 
 
538 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  28.48 
 
 
538 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  28.97 
 
 
538 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  27.2 
 
 
602 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  27.62 
 
 
539 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.1 
 
 
649 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.83 
 
 
652 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.32 
 
 
649 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.87 
 
 
649 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  22.65 
 
 
649 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  35.86 
 
 
184 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1874  hypothetical protein  27.78 
 
 
206 aa  58.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3462  hypothetical protein  33.04 
 
 
227 aa  57.4  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00892274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.47 
 
 
483 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2194  hypothetical protein  28.03 
 
 
217 aa  54.3  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2096  hypothetical protein  30.43 
 
 
228 aa  53.9  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.57 
 
 
490 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  38.95 
 
 
161 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  44.3 
 
 
159 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  39.47 
 
 
633 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.09 
 
 
483 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1324  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.71 
 
 
240 aa  51.2  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.711036  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0587  hypothetical protein  28.47 
 
 
201 aa  51.2  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0839673  hitchhiker  0.000680338 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0351  hypothetical protein  26.62 
 
 
219 aa  50.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  43.06 
 
 
159 aa  50.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  43.06 
 
 
159 aa  50.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  43.06 
 
 
159 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  46.55 
 
 
158 aa  47.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  45.83 
 
 
161 aa  47.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  42.67 
 
 
166 aa  47.4  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  46.55 
 
 
160 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  43.06 
 
 
159 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  44.64 
 
 
634 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.37 
 
 
482 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.75 
 
 
476 aa  46.2  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  42.62 
 
 
151 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  54.17 
 
 
155 aa  45.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  44.44 
 
 
469 aa  45.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.79 
 
 
484 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  27.89 
 
 
161 aa  44.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4416  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.51 
 
 
755 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>