More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3186 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
382 aa  743    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  76.06 
 
 
383 aa  527  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  59.68 
 
 
370 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  60.37 
 
 
392 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  60.88 
 
 
375 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  60.81 
 
 
390 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  59.56 
 
 
393 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  58.92 
 
 
389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  58.11 
 
 
389 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  57.18 
 
 
377 aa  398  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  57.82 
 
 
385 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  56.49 
 
 
368 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  58.71 
 
 
376 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  57.26 
 
 
373 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  57.26 
 
 
373 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  57.37 
 
 
378 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  57.64 
 
 
378 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  56.57 
 
 
371 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  57.37 
 
 
378 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  54.3 
 
 
370 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  57.64 
 
 
376 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  54.79 
 
 
387 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  54.3 
 
 
374 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  56.84 
 
 
378 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  53.08 
 
 
379 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  53.76 
 
 
374 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  54.59 
 
 
386 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  56.3 
 
 
379 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  56.06 
 
 
379 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  56.72 
 
 
377 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  56.72 
 
 
377 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  57.37 
 
 
376 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  56.45 
 
 
396 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  56.22 
 
 
368 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  54.96 
 
 
376 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  57.1 
 
 
368 aa  360  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  56.15 
 
 
377 aa  329  6e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  51.34 
 
 
373 aa  324  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  53.68 
 
 
380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  46.11 
 
 
376 aa  301  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
372 aa  300  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  43.28 
 
 
373 aa  298  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  45.43 
 
 
373 aa  295  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  43.32 
 
 
390 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  52.86 
 
 
377 aa  293  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
373 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 
373 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  45.16 
 
 
373 aa  292  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  47.15 
 
 
372 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  47.68 
 
 
371 aa  292  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  47.15 
 
 
372 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 
367 aa  287  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  46.24 
 
 
372 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  46.34 
 
 
368 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  47.43 
 
 
372 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 
372 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 
372 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  47.33 
 
 
374 aa  285  8e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  47.15 
 
 
372 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  46.65 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  45.67 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 
373 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 
372 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  44.72 
 
 
372 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  47.04 
 
 
372 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 
372 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  44.56 
 
 
373 aa  280  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  41.03 
 
 
372 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  43.82 
 
 
374 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 
372 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  42.01 
 
 
376 aa  277  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  45.8 
 
 
378 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  47.43 
 
 
374 aa  276  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  45.97 
 
 
373 aa  276  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  46.99 
 
 
363 aa  276  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  45.33 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  45.24 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  46.09 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  44.8 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0456  glutamate 5-kinase  38.76 
 
 
381 aa  272  6e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0927059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  46.19 
 
 
378 aa  272  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  43.78 
 
 
369 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  43.82 
 
 
372 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 
374 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  48.51 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  44.65 
 
 
375 aa  270  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  44.99 
 
 
372 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 
374 aa  269  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  45.84 
 
 
376 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  45.84 
 
 
376 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2219  gamma-glutamyl kinase  52.59 
 
 
368 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102835  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  39.02 
 
 
371 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  45.19 
 
 
376 aa  266  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  46.28 
 
 
385 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  46.24 
 
 
372 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  41.88 
 
 
374 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  36.12 
 
 
373 aa  265  8.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  46.34 
 
 
372 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>