More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  100 
 
 
419 aa  815    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  72.51 
 
 
382 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  66.94 
 
 
393 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  72.51 
 
 
372 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  61.58 
 
 
374 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  59.73 
 
 
388 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  59.19 
 
 
375 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1625  glutamate 5-kinase  63.51 
 
 
379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.795744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7268  Glutamate 5-kinase  61.58 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  56.83 
 
 
390 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  55.98 
 
 
377 aa  382  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  57.06 
 
 
381 aa  383  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  58.11 
 
 
373 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  58.87 
 
 
385 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  59.57 
 
 
388 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  57.7 
 
 
383 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3454  glutamate 5-kinase  60.16 
 
 
382 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.281717  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  57.46 
 
 
371 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0386  gamma-glutamyl kinase  58.51 
 
 
385 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.969729  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  56.58 
 
 
393 aa  363  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  56.49 
 
 
401 aa  363  3e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  58.42 
 
 
369 aa  362  8e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  55.14 
 
 
372 aa  359  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1223  gamma-glutamyl kinase  57.34 
 
 
371 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.826884  normal  0.429771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5257  gamma-glutamyl kinase  56.99 
 
 
371 aa  352  7e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  54.11 
 
 
412 aa  339  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  50.13 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  51.77 
 
 
366 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1190  glutamate 5-kinase  57.95 
 
 
376 aa  316  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  51.66 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3547  gamma-glutamyl kinase  50.13 
 
 
377 aa  312  9e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3552  gamma-glutamyl kinase  50.13 
 
 
377 aa  312  9e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3620  gamma-glutamyl kinase  50.13 
 
 
377 aa  312  9e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  50.54 
 
 
376 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2062  glutamate 5-kinase  50.27 
 
 
371 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1476  glutamate 5-kinase  51.09 
 
 
377 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.324242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  39.25 
 
 
373 aa  282  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
373 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  39.62 
 
 
372 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  43.65 
 
 
367 aa  270  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  41.58 
 
 
369 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  40.75 
 
 
373 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  42.13 
 
 
378 aa  266  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 
369 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  41.15 
 
 
376 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  45.75 
 
 
372 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  41.51 
 
 
374 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  45.75 
 
 
372 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
367 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  43.55 
 
 
387 aa  260  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  42.86 
 
 
366 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  42.05 
 
 
376 aa  259  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  41.26 
 
 
369 aa  259  7e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  37.63 
 
 
373 aa  259  8e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  42.11 
 
 
369 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  42.11 
 
 
369 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  39.52 
 
 
390 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  42.08 
 
 
382 aa  256  6e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  43.99 
 
 
374 aa  256  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  44.44 
 
 
368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  42.54 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 
379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2164  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
373 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.587053 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  41.26 
 
 
376 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  41.6 
 
 
372 aa  249  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  41.73 
 
 
383 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  42.97 
 
 
374 aa  249  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  36.93 
 
 
371 aa  249  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  41.78 
 
 
374 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  41.73 
 
 
383 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  40.7 
 
 
372 aa  247  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  40.65 
 
 
371 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  40.69 
 
 
374 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  43.13 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  41.07 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
372 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  38.65 
 
 
373 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  41.58 
 
 
385 aa  245  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  40.49 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  41.71 
 
 
379 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
373 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  40.16 
 
 
372 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  40.16 
 
 
372 aa  243  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  41.51 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  41.51 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  41.51 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  41.51 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  41.51 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  41.51 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  40.71 
 
 
376 aa  243  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  44 
 
 
386 aa  243  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  41.32 
 
 
372 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  41.24 
 
 
372 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 
372 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  41.15 
 
 
385 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  40.22 
 
 
373 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  40.5 
 
 
372 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  40.5 
 
 
372 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  40.5 
 
 
372 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  40.5 
 
 
372 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>