More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3311 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
373 aa  756    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  60.38 
 
 
373 aa  474  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  62.63 
 
 
374 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  55.31 
 
 
378 aa  428  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  55.8 
 
 
375 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  53.59 
 
 
372 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  50.95 
 
 
370 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  51.38 
 
 
367 aa  364  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  51.66 
 
 
393 aa  363  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
373 aa  362  6e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  49.19 
 
 
387 aa  355  5.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  48.12 
 
 
390 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 
373 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  48.63 
 
 
373 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 
376 aa  346  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  50 
 
 
366 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  48.66 
 
 
372 aa  341  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  49.58 
 
 
363 aa  341  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
373 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  49.58 
 
 
373 aa  338  9e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 
372 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  47.8 
 
 
367 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  47.85 
 
 
373 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  47.4 
 
 
373 aa  333  4e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  46.72 
 
 
373 aa  332  5e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  48.5 
 
 
372 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  48.07 
 
 
371 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 
374 aa  331  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 
373 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  48.23 
 
 
372 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  45.82 
 
 
376 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  47.31 
 
 
373 aa  328  7e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  47.83 
 
 
369 aa  328  9e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  46.45 
 
 
373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  47.8 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 
372 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  48.48 
 
 
372 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 
372 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 
372 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  47.03 
 
 
383 aa  324  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  48.48 
 
 
372 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  47.11 
 
 
372 aa  323  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  48.48 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  47.93 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  46.83 
 
 
369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  47.93 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  45.14 
 
 
376 aa  319  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  45.14 
 
 
376 aa  319  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
372 aa  319  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  47.38 
 
 
372 aa  319  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 
394 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  45.41 
 
 
379 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 
374 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 
372 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 
372 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 
372 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  46.45 
 
 
369 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 
372 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  47.66 
 
 
372 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 
372 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 
372 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
374 aa  316  5e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  46.2 
 
 
375 aa  316  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  45.18 
 
 
372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  45.18 
 
 
372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  45.18 
 
 
372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  45.18 
 
 
372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
372 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  46.07 
 
 
376 aa  312  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
372 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  46.83 
 
 
372 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2885  glutamate 5-kinase  48.75 
 
 
375 aa  312  6.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.732421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 
370 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  43.7 
 
 
392 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 
376 aa  310  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  44.39 
 
 
376 aa  310  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2415  gamma-glutamyl kinase  45.48 
 
 
375 aa  310  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0941339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  45.18 
 
 
372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
369 aa  309  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.17 
 
 
375 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  44.62 
 
 
378 aa  308  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  47.93 
 
 
372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  46.56 
 
 
374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  47.11 
 
 
372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  44.75 
 
 
380 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 
372 aa  305  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
367 aa  305  8.000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 
367 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  43.44 
 
 
367 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 
367 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  46.63 
 
 
379 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 
367 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 
367 aa  305  9.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 
367 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 
367 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  43.44 
 
 
367 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 
367 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>