More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1170 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  100 
 
 
366 aa  742    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
373 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
373 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  49.7 
 
 
372 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  49.7 
 
 
372 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  49.7 
 
 
372 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  49.7 
 
 
372 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  46.99 
 
 
376 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  44.44 
 
 
373 aa  311  9e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  48.35 
 
 
378 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  48.38 
 
 
379 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  47.73 
 
 
372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  45.63 
 
 
390 aa  309  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  47.29 
 
 
373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 
374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  46.05 
 
 
373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  48.8 
 
 
367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  50.3 
 
 
372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  49.7 
 
 
372 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  46.11 
 
 
372 aa  300  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  47.45 
 
 
369 aa  300  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  47.16 
 
 
373 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  44.53 
 
 
387 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 
372 aa  300  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  49.7 
 
 
372 aa  299  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  49.4 
 
 
372 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  49.4 
 
 
372 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 
374 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  46.84 
 
 
370 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
374 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  45.17 
 
 
372 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  47.43 
 
 
367 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2885  glutamate 5-kinase  52.13 
 
 
375 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.732421  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  46.24 
 
 
374 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  45.36 
 
 
372 aa  294  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  45.08 
 
 
367 aa  294  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  46.13 
 
 
375 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  45.6 
 
 
369 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  47.76 
 
 
368 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  48.84 
 
 
375 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  45.88 
 
 
372 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  45.93 
 
 
378 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  48.97 
 
 
371 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 
370 aa  290  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  45.3 
 
 
372 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  46.17 
 
 
379 aa  288  7e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  45.03 
 
 
372 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  45.06 
 
 
378 aa  288  9e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  45.36 
 
 
373 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 
369 aa  288  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 
379 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  47.9 
 
 
369 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  45.03 
 
 
372 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  43.48 
 
 
382 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 
372 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  49.24 
 
 
369 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  49.24 
 
 
369 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  45.86 
 
 
372 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  44.48 
 
 
376 aa  285  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  44.48 
 
 
376 aa  285  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  41.92 
 
 
414 aa  285  7e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  46.41 
 
 
373 aa  285  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2782  gamma-glutamyl kinase  41.85 
 
 
386 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2993  gamma-glutamyl kinase  41.85 
 
 
367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0371312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  43.32 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2731  gamma-glutamyl kinase  42.08 
 
 
367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.681292  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  46.53 
 
 
372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2712  gamma-glutamyl kinase  41.96 
 
 
386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  45.98 
 
 
363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  45.3 
 
 
372 aa  283  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  45.35 
 
 
372 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  45.86 
 
 
372 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  43.44 
 
 
382 aa  282  7.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  46.53 
 
 
372 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  46.53 
 
 
372 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  43.99 
 
 
379 aa  282  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  42.29 
 
 
367 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  42.29 
 
 
367 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  46.53 
 
 
372 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  42.29 
 
 
367 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  42.29 
 
 
367 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  46.53 
 
 
372 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  42.29 
 
 
367 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  45.95 
 
 
372 aa  281  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3029  gamma-glutamyl kinase  41.58 
 
 
367 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0863421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  43.7 
 
 
374 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  43.72 
 
 
373 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  43.32 
 
 
390 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  46.08 
 
 
376 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  46.3 
 
 
372 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  45.08 
 
 
378 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  45.58 
 
 
372 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  41.69 
 
 
367 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  43.72 
 
 
373 aa  279  5e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  45.66 
 
 
372 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  45.66 
 
 
372 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  45.66 
 
 
372 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  45.66 
 
 
372 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  45.66 
 
 
372 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>