More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0281 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  100 
 
 
376 aa  750    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  100 
 
 
376 aa  750    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  58.42 
 
 
390 aa  424  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  58.7 
 
 
372 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  56.37 
 
 
374 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  59.51 
 
 
375 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  55.8 
 
 
372 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  56.87 
 
 
372 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  55.8 
 
 
372 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  56.64 
 
 
376 aa  411  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  58.81 
 
 
375 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  57.42 
 
 
368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  56.87 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  57.22 
 
 
374 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  53.95 
 
 
376 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  59.57 
 
 
378 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  56.87 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  56.64 
 
 
376 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  54.45 
 
 
372 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  54.62 
 
 
378 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  56.22 
 
 
379 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  56.87 
 
 
374 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  56.06 
 
 
372 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  56.33 
 
 
372 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  56.06 
 
 
372 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  56.33 
 
 
372 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  56.6 
 
 
372 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  56.68 
 
 
373 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  55.26 
 
 
373 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  54.32 
 
 
371 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  55.16 
 
 
378 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  55.8 
 
 
372 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  56.32 
 
 
374 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  56.38 
 
 
380 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  53.26 
 
 
378 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  55.26 
 
 
372 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  54.72 
 
 
372 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  54.99 
 
 
372 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  54.45 
 
 
372 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  54.45 
 
 
372 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  54.45 
 
 
372 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  56.04 
 
 
374 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  53.6 
 
 
382 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  54.72 
 
 
372 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  54.72 
 
 
372 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  54.72 
 
 
372 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  54.84 
 
 
372 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  54.45 
 
 
372 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  54.45 
 
 
372 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  54.67 
 
 
380 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  54.45 
 
 
372 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  54.45 
 
 
372 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  54.72 
 
 
372 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  54.45 
 
 
372 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  54.45 
 
 
372 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  54.4 
 
 
380 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  55.77 
 
 
374 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  54.45 
 
 
394 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  53.37 
 
 
372 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  54.18 
 
 
372 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  54.16 
 
 
380 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  53.64 
 
 
372 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1783  glutamate 5-kinase  58.76 
 
 
383 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00674296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1460  glutamate 5-kinase  58.76 
 
 
399 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3672  gamma-glutamyl kinase  54.88 
 
 
379 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.039065  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  55.04 
 
 
374 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 
376 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  48.1 
 
 
373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  48.37 
 
 
373 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  46.87 
 
 
390 aa  316  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  45.3 
 
 
372 aa  316  5e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  47.3 
 
 
370 aa  315  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 
374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  44.09 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  44.39 
 
 
373 aa  302  7.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1600  gamma-glutamyl kinase  47.27 
 
 
405 aa  302  8.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157762  hitchhiker  0.000100305 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  47.79 
 
 
367 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  45.14 
 
 
373 aa  295  7e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  47.65 
 
 
363 aa  295  9e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1682  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 
390 aa  294  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  47.14 
 
 
373 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 
378 aa  293  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  45.53 
 
 
392 aa  293  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  56.64 
 
 
260 aa  292  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1503  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
390 aa  292  8e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0215  glutamate 5-kinase  56.81 
 
 
260 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.256743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  45.36 
 
 
367 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
369 aa  287  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  44.29 
 
 
389 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  44.02 
 
 
389 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  46.5 
 
 
373 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  44.48 
 
 
366 aa  285  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  43.63 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  43.55 
 
 
383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  42.97 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  40.6 
 
 
373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>