More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1065 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  93.57 
 
 		 373 aa  719    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  93.03 
 
 		 373 aa  715    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 373 aa  755    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  49.45 
 
 		 393 aa  348  9e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  45.58 
 
 		 370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  48.64 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  48.37 
 
 		 372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 		 370 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  47.54 
 
 		 373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  48.1 
 
 		 372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  47.68 
 
 		 369 aa  335  7.999999999999999e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  47.28 
 
 		 372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  47.14 
 
 		 378 aa  329  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  49.59 
 
 		 379 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  47.28 
 
 		 379 aa  326  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2272  gamma-glutamyl kinase  51.23 
 
 		 370 aa  325  9e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918384 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  46.72 
 
 		 372 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  48.49 
 
 		 377 aa  323  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  49.32 
 
 		 379 aa  324  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  47.97 
 
 		 372 aa  322  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  48.5 
 
 		 374 aa  322  5e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 		 363 aa  322  7e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  47.97 
 
 		 372 aa  322  8e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  47.97 
 
 		 372 aa  322  8e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  47.97 
 
 		 372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  47.97 
 
 		 372 aa  320  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  46.45 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  47.14 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  45.68 
 
 		 371 aa  306  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  44.41 
 
 		 374 aa  306  6e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  46.87 
 
 		 373 aa  305  7e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  44.44 
 
 		 375 aa  305  7e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  46.47 
 
 		 369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  44.24 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  45.04 
 
 		 387 aa  302  6.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  43.25 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  43.25 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 		 376 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  43.25 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  43.25 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  43.25 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  46.54 
 
 		 373 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  44.41 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  43.7 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  44.41 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  43.53 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  43.53 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  45.23 
 
 		 373 aa  298  7e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  46.54 
 
 		 373 aa  299  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  44.26 
 
 		 376 aa  298  9e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 		 372 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  43.6 
 
 		 376 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 		 374 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 		 378 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 		 373 aa  293  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  45.08 
 
 		 367 aa  292  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  43.6 
 
 		 373 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.05 
 
 		 375 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 		 367 aa  290  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  43.05 
 
 		 373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44.96 
 
 		 374 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 		 372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 		 372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  40.86 
 
 		 383 aa  289  6e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 		 372 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 		 379 aa  288  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  43.99 
 
 		 367 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  42.51 
 
 		 372 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  44.93 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  42.16 
 
 		 406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 		 372 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 		 372 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 		 372 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 		 372 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>