More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0762 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  91.28 
 
 
393 aa  670    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
367 aa  734    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2272  gamma-glutamyl kinase  69.23 
 
 
370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  62.88 
 
 
370 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  60.06 
 
 
363 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  53.28 
 
 
367 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  53.28 
 
 
367 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  53.28 
 
 
367 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  53.28 
 
 
367 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  53.28 
 
 
367 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  53.28 
 
 
367 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  53.28 
 
 
367 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  52.2 
 
 
370 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  52.34 
 
 
369 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  53.13 
 
 
367 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  53.28 
 
 
367 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  53.28 
 
 
367 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  52.46 
 
 
367 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  52.46 
 
 
367 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  52.46 
 
 
367 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  52.46 
 
 
367 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  52.46 
 
 
367 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  51.77 
 
 
369 aa  362  8e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
372 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
372 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
372 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
372 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  51.9 
 
 
373 aa  358  9e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  51.77 
 
 
367 aa  357  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  50.41 
 
 
372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  51.79 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  50.96 
 
 
372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  50.14 
 
 
373 aa  355  8.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
373 aa  354  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  50.41 
 
 
372 aa  352  7e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  50.82 
 
 
379 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  49.59 
 
 
373 aa  348  6e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  50.41 
 
 
374 aa  348  7e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
379 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  52.34 
 
 
372 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  51.77 
 
 
367 aa  346  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  51.77 
 
 
367 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  51.77 
 
 
367 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  52.72 
 
 
367 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  53.41 
 
 
367 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
372 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  50.83 
 
 
373 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  51.79 
 
 
372 aa  342  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  51.79 
 
 
372 aa  342  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  51.79 
 
 
372 aa  342  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  52.32 
 
 
367 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  50.68 
 
 
377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  52.04 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  47.11 
 
 
372 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  47.96 
 
 
373 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 
378 aa  333  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
376 aa  332  8e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  49.59 
 
 
378 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
374 aa  325  6e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  49.31 
 
 
370 aa  324  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  48.35 
 
 
372 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  47.67 
 
 
373 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  48.22 
 
 
390 aa  319  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  47.97 
 
 
373 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  48.37 
 
 
372 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  44.08 
 
 
373 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 
372 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
394 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  47.68 
 
 
372 aa  315  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  48.48 
 
 
372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  48.76 
 
 
372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  48.06 
 
 
375 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
372 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
372 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  46.05 
 
 
371 aa  311  7.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  47.79 
 
 
372 aa  311  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  47.93 
 
 
376 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  48.48 
 
 
372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  47.27 
 
 
367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  44.35 
 
 
373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  47.54 
 
 
371 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  48.88 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  45.63 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  47.27 
 
 
374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  45.86 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  48.6 
 
 
373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  47.03 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 
378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  48.07 
 
 
367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>