More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4215 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 379 aa  756    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  84.92 
 
 		 378 aa  657    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  83.86 
 
 		 378 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  84.45 
 
 		 378 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  86.93 
 
 		 380 aa  633  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  86.67 
 
 		 380 aa  631  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  84.22 
 
 		 380 aa  613  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3672  gamma-glutamyl kinase  85.15 
 
 		 379 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.039065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  80.64 
 
 		 382 aa  604  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  80 
 
 		 372 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  78.98 
 
 		 372 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  71.58 
 
 		 372 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  72.4 
 
 		 372 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  72.13 
 
 		 372 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  72.13 
 
 		 372 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  71.35 
 
 		 372 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  71.08 
 
 		 372 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  71.86 
 
 		 372 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  71.86 
 
 		 372 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  71.86 
 
 		 372 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  70.27 
 
 		 372 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  71.31 
 
 		 372 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  70.81 
 
 		 372 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  71.31 
 
 		 372 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  71.58 
 
 		 372 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  72.4 
 
 		 374 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  71.31 
 
 		 372 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  71.31 
 
 		 372 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  71.31 
 
 		 372 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  71.31 
 
 		 372 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  72.13 
 
 		 374 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  70.54 
 
 		 372 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  71.31 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  65.14 
 
 		 372 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  71.86 
 
 		 374 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  66.67 
 
 		 372 aa  488  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  66.31 
 
 		 374 aa  486  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  63.07 
 
 		 372 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  64.13 
 
 		 371 aa  471  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  59.67 
 
 		 374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  59.08 
 
 		 390 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  59.57 
 
 		 378 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  58.36 
 
 		 368 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  57.18 
 
 		 376 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  59.45 
 
 		 375 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  55.46 
 
 		 376 aa  413  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  57.81 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  57.81 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  58.9 
 
 		 372 aa  401  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  56.52 
 
 		 375 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  56.22 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  56.22 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  57.53 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  57.53 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  57.81 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  59.13 
 
 		 380 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  57.26 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  57.26 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  57.26 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  53.07 
 
 		 376 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  56.99 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  55.34 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  54.08 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  57.88 
 
 		 374 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  67.83 
 
 		 260 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0215  glutamate 5-kinase  66.8 
 
 		 260 aa  338  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.256743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  47.28 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1600  gamma-glutamyl kinase  48.78 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157762  hitchhiker  0.000100305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 		 376 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  47.96 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1783  glutamate 5-kinase  52.29 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00674296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1460  glutamate 5-kinase  52.29 
 
 		 399 aa  317  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1503  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  47.3 
 
 		 373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1682  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  45.62 
 
 		 378 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 		 374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  42.86 
 
 		 373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  46.67 
 
 		 387 aa  306  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  47.09 
 
 		 370 aa  305  9.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 		 372 aa  301  9e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  43.6 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  46.07 
 
 		 373 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  46.83 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  48.32 
 
 		 373 aa  295  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  43.32 
 
 		 373 aa  295  9e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  44.47 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  46.98 
 
 		 385 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  45.36 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  46.98 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.762556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  45.9 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  45.9 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  46.9 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>