More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3212 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
373 aa  750    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  83.38 
 
 
373 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  75.34 
 
 
390 aa  558  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  68.36 
 
 
373 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  61.39 
 
 
376 aa  471  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  65.42 
 
 
373 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  64.88 
 
 
373 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  57.8 
 
 
373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
380 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  47.66 
 
 
372 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
378 aa  360  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  51.52 
 
 
377 aa  360  3e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  48.39 
 
 
376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  51.48 
 
 
372 aa  353  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  48.66 
 
 
373 aa  352  8e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  48.53 
 
 
392 aa  349  5e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  51.09 
 
 
375 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  49.59 
 
 
383 aa  347  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  47.71 
 
 
376 aa  343  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  50.41 
 
 
370 aa  344  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 
372 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  49.46 
 
 
368 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
393 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  50.8 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  49.59 
 
 
375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  48.25 
 
 
379 aa  339  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
374 aa  339  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  47.68 
 
 
395 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  48.51 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  49.73 
 
 
383 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  49.73 
 
 
383 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  48.79 
 
 
374 aa  335  5.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  47.83 
 
 
375 aa  335  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
367 aa  335  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  48.48 
 
 
363 aa  335  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  49.59 
 
 
372 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  48.94 
 
 
379 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
372 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
372 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  47.85 
 
 
373 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  49.32 
 
 
372 aa  332  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  46.98 
 
 
367 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  47.97 
 
 
372 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 
372 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 
372 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 
372 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 
372 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  47.01 
 
 
376 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  48.76 
 
 
374 aa  330  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  46.7 
 
 
369 aa  329  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  43.82 
 
 
373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  49.05 
 
 
372 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  46.93 
 
 
384 aa  328  9e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  47.14 
 
 
373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  47.41 
 
 
373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  49.33 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  49.33 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  50.13 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  49.33 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  47.97 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  47.62 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  49.33 
 
 
372 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  48.79 
 
 
372 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 
372 aa  326  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  49.87 
 
 
372 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  47.3 
 
 
378 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2179  gamma-glutamyl kinase  47.2 
 
 
378 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  47.54 
 
 
369 aa  324  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  48.53 
 
 
374 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  47.76 
 
 
382 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  48.13 
 
 
376 aa  322  6e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 
372 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 
372 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 
372 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 
372 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 
372 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 
372 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  48.26 
 
 
372 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 
394 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  48.26 
 
 
372 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  46.87 
 
 
373 aa  322  9.000000000000001e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  48.79 
 
 
373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  48.79 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  49.19 
 
 
372 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 
369 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 
369 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 
374 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  46.59 
 
 
376 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  49.45 
 
 
372 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  43.01 
 
 
373 aa  317  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  46.68 
 
 
373 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  47.61 
 
 
380 aa  316  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  50.14 
 
 
380 aa  316  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  45.88 
 
 
365 aa  315  9e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 
369 aa  315  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  45.9 
 
 
367 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>