More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1872 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
374 aa  760    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  64.71 
 
 
373 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  62.73 
 
 
373 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  58.01 
 
 
372 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  60 
 
 
378 aa  448  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  55.8 
 
 
375 aa  412  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  50.66 
 
 
387 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
373 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  50.81 
 
 
376 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  49.19 
 
 
390 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  47.8 
 
 
373 aa  358  9e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  47.45 
 
 
373 aa  352  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  52.08 
 
 
370 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  48.5 
 
 
373 aa  346  5e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
367 aa  345  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  51.52 
 
 
393 aa  345  6e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  49.59 
 
 
367 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
373 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  48.37 
 
 
383 aa  344  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
373 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  47.14 
 
 
373 aa  343  4e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  48.5 
 
 
373 aa  340  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  47.96 
 
 
376 aa  339  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  46.98 
 
 
369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  49.19 
 
 
372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
367 aa  336  3.9999999999999995e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
373 aa  335  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  51.1 
 
 
363 aa  335  7e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  50.14 
 
 
372 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  48.92 
 
 
373 aa  333  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  46.9 
 
 
390 aa  331  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  49.2 
 
 
383 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  47.7 
 
 
392 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  48.67 
 
 
379 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  48.13 
 
 
382 aa  329  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  49.73 
 
 
377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  49.2 
 
 
383 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  47.99 
 
 
372 aa  328  7e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  49.46 
 
 
372 aa  328  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  48.12 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 
369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  49.05 
 
 
378 aa  327  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  49.59 
 
 
372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  47.93 
 
 
372 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  47.53 
 
 
372 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  47.93 
 
 
372 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  46.88 
 
 
376 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 
379 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  46.88 
 
 
376 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0456  glutamate 5-kinase  43.08 
 
 
381 aa  323  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0927059  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  43.97 
 
 
373 aa  323  3e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
369 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
369 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 
378 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  45.65 
 
 
366 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  47.81 
 
 
376 aa  322  7e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  48.37 
 
 
367 aa  322  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  47.11 
 
 
377 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  46.85 
 
 
370 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  47.66 
 
 
368 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  47.8 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  48.92 
 
 
372 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  48.1 
 
 
367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  48.1 
 
 
367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  48.1 
 
 
367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  46.87 
 
 
372 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  48.1 
 
 
367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  48.1 
 
 
367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  48.1 
 
 
367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  48.1 
 
 
367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  48.1 
 
 
367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  48.1 
 
 
367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
372 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
372 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
372 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
372 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  47.57 
 
 
372 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  47.57 
 
 
372 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  47.8 
 
 
374 aa  318  9e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 
372 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  48.23 
 
 
378 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  47.12 
 
 
369 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  48.22 
 
 
372 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  49.05 
 
 
372 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  50.4 
 
 
380 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>