More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3863 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 373 aa  743    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  98.93 
 
 		 373 aa  735    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  71.58 
 
 		 390 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  66.22 
 
 		 373 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  65.42 
 
 		 373 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  60.86 
 
 		 376 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  63.54 
 
 		 373 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  56.18 
 
 		 373 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  49.59 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  50.81 
 
 		 373 aa  364  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 		 374 aa  359  3e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 		 373 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 		 372 aa  354  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 		 372 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  50.67 
 
 		 392 aa  352  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  49.73 
 
 		 383 aa  352  5.9999999999999994e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  50.82 
 
 		 376 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  50.67 
 
 		 372 aa  348  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  50.55 
 
 		 368 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  50.67 
 
 		 375 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  48.25 
 
 		 372 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  44.62 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 		 375 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  50.94 
 
 		 372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 		 371 aa  343  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  46.47 
 
 		 378 aa  342  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  48.37 
 
 		 375 aa  341  9e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  51.38 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  46.77 
 
 		 376 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 		 372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 		 372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  47.44 
 
 		 376 aa  339  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 		 372 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 		 372 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  48.26 
 
 		 374 aa  338  9e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 		 372 aa  338  9e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 		 367 aa  337  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  49.33 
 
 		 372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  48.5 
 
 		 373 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 		 372 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 		 372 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  49.33 
 
 		 372 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  50.69 
 
 		 363 aa  334  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 		 372 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 		 372 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 		 372 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 		 372 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  49.04 
 
 		 377 aa  332  6e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  50.55 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  50.55 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  48.08 
 
 		 372 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 		 372 aa  329  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  47.54 
 
 		 369 aa  329  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  47.55 
 
 		 378 aa  329  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 		 372 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  48.08 
 
 		 372 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  47.83 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  47.85 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  47.43 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  47.53 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  48.37 
 
 		 379 aa  327  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  44.62 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  47.14 
 
 		 373 aa  325  6e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  46.87 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  47.23 
 
 		 382 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 		 374 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  47.59 
 
 		 377 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  49.73 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  47.53 
 
 		 367 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  47.87 
 
 		 379 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  47.47 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  49.31 
 
 		 374 aa  322  7e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  49.05 
 
 		 372 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  48.92 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  49.46 
 
 		 374 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  47.07 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  48.08 
 
 		 379 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  47.55 
 
 		 378 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  45.88 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 		 373 aa  319  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  49.45 
 
 		 372 aa  319  6e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  47.98 
 
 		 378 aa  319  6e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  46.7 
 
 		 372 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  46.7 
 
 		 372 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  46.7 
 
 		 372 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  46.7 
 
 		 372 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  45.88 
 
 		 369 aa  318  9e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  47.07 
 
 		 383 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  46.7 
 
 		 374 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2179  gamma-glutamyl kinase  47.2 
 
 		 378 aa  317  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  46.15 
 
 		 371 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  45.7 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>