More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0239 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 367 aa  739    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  100 
 
 		 367 aa  739    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 367 aa  739    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 367 aa  739    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  739    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  89.32 
 
 		 367 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 367 aa  739    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  96.73 
 
 		 367 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 367 aa  739    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  97.28 
 
 		 367 aa  723    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  96.73 
 
 		 367 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  96.73 
 
 		 367 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 367 aa  739    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 367 aa  739    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  96.73 
 
 		 367 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  96.73 
 
 		 367 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  87.12 
 
 		 367 aa  627  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  87.12 
 
 		 367 aa  627  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  87.12 
 
 		 367 aa  627  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  88.22 
 
 		 367 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  88.22 
 
 		 367 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  87.4 
 
 		 367 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  85.21 
 
 		 367 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  66.03 
 
 		 369 aa  492  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  65.85 
 
 		 379 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  65.57 
 
 		 379 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  66.57 
 
 		 377 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  65.47 
 
 		 370 aa  462  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 374 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  63.33 
 
 		 372 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  63.33 
 
 		 372 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  63.33 
 
 		 372 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  63.33 
 
 		 372 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  63.06 
 
 		 369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  62.6 
 
 		 372 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  61.94 
 
 		 372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  63.43 
 
 		 379 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  60.66 
 
 		 372 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  63.71 
 
 		 372 aa  431  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  63.16 
 
 		 372 aa  428  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  59.94 
 
 		 370 aa  428  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  63.43 
 
 		 372 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  63.43 
 
 		 372 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  63.06 
 
 		 372 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  58.08 
 
 		 378 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  53.28 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  51.53 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  52.19 
 
 		 393 aa  358  6e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  50.83 
 
 		 370 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2272  gamma-glutamyl kinase  54.85 
 
 		 370 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918384 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  46.72 
 
 		 373 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  48.61 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  47.12 
 
 		 373 aa  311  9e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 		 373 aa  310  2e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  48.1 
 
 		 374 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  46.78 
 
 		 377 aa  302  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  43.32 
 
 		 371 aa  302  5.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 		 378 aa  302  6.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 		 390 aa  301  9e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  44.6 
 
 		 373 aa  300  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 		 373 aa  299  4e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  45.36 
 
 		 368 aa  298  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  43.61 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  44.23 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  46.5 
 
 		 383 aa  296  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  44.81 
 
 		 371 aa  296  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  47.11 
 
 		 373 aa  295  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  44.08 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  47.19 
 
 		 373 aa  293  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 		 369 aa  291  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 		 369 aa  291  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  43.96 
 
 		 367 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  46.91 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  42.62 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 379 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  42.62 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  43.65 
 
 		 373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.44 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  42.62 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 		 372 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  45.36 
 
 		 378 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  44.83 
 
 		 378 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  44.81 
 
 		 376 aa  286  5e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  42.62 
 
 		 373 aa  285  7e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 		 375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 		 372 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 		 373 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 		 374 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  43.44 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  45.04 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  43.17 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  43.21 
 
 		 375 aa  279  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>