More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1608 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
375 aa  764    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  55.71 
 
 
373 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  54.03 
 
 
378 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  55.8 
 
 
373 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  54.72 
 
 
372 aa  411  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  55.8 
 
 
374 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  51.33 
 
 
387 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  47.99 
 
 
373 aa  358  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  50.95 
 
 
373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  50.83 
 
 
370 aa  348  7e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  45.75 
 
 
376 aa  345  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  47.83 
 
 
376 aa  342  8e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  46.76 
 
 
390 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  49.59 
 
 
373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
373 aa  337  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  49.3 
 
 
373 aa  332  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  49.01 
 
 
373 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  46.77 
 
 
373 aa  332  8e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  47.44 
 
 
392 aa  329  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  46.72 
 
 
371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  47.81 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  48.11 
 
 
373 aa  326  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  48.33 
 
 
363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  48.48 
 
 
367 aa  323  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  47.67 
 
 
369 aa  322  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  44.72 
 
 
373 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  46.56 
 
 
379 aa  318  9e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  46.2 
 
 
372 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  47.5 
 
 
367 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 
372 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  44.44 
 
 
373 aa  315  9e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  47.65 
 
 
393 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  45.9 
 
 
376 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  45.92 
 
 
372 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 
369 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
372 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 
369 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 
374 aa  310  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  46.56 
 
 
372 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 
372 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  43.36 
 
 
373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
372 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 
372 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
374 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.84 
 
 
375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
374 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 
371 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  46.47 
 
 
372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  46.47 
 
 
372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  44.75 
 
 
368 aa  305  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  46.47 
 
 
372 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  44.29 
 
 
372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  44.29 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  48.34 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  42.93 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  46.58 
 
 
378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  45.18 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  46.83 
 
 
372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  46.56 
 
 
372 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 
372 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  46.56 
 
 
372 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  43.84 
 
 
376 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  43.84 
 
 
376 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  44.29 
 
 
372 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  46.2 
 
 
372 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  46.03 
 
 
378 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  45.11 
 
 
372 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 
372 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  44.29 
 
 
373 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  44.57 
 
 
372 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  46.56 
 
 
372 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  46.56 
 
 
372 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  44.26 
 
 
369 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  45.38 
 
 
372 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2415  gamma-glutamyl kinase  43.65 
 
 
375 aa  299  6e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0941339  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
367 aa  299  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  45.75 
 
 
379 aa  299  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  45.92 
 
 
372 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  45.92 
 
 
372 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  45.92 
 
 
372 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  45.92 
 
 
372 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  45.92 
 
 
372 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  45.92 
 
 
372 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  45.92 
 
 
394 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  45.88 
 
 
376 aa  298  9e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44.5 
 
 
374 aa  298  9e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  43.94 
 
 
376 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  45.86 
 
 
378 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
373 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  44.95 
 
 
382 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>