More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1120 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
374 aa  738    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  73.78 
 
 
372 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  71.35 
 
 
372 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  72.16 
 
 
372 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  72.43 
 
 
372 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  67.92 
 
 
372 aa  508  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  72.43 
 
 
372 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  68.82 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  71.89 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
372 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
372 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
372 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
372 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
372 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
372 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
372 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
372 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
372 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
372 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
372 aa  501  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  71.35 
 
 
372 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
372 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
372 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  71.62 
 
 
394 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  72.7 
 
 
374 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  72.97 
 
 
374 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  68.65 
 
 
372 aa  488  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  72.43 
 
 
374 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  67.76 
 
 
371 aa  484  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  66.31 
 
 
379 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  66.13 
 
 
378 aa  484  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  65.95 
 
 
378 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  64.25 
 
 
378 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  64.38 
 
 
382 aa  471  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  65.22 
 
 
372 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  67.12 
 
 
372 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  64.95 
 
 
372 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  66.84 
 
 
380 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  64.93 
 
 
368 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  66.58 
 
 
380 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  65.87 
 
 
380 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  66.58 
 
 
375 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  62.5 
 
 
376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  60.99 
 
 
374 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  65.41 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  64.66 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  63.81 
 
 
373 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3672  gamma-glutamyl kinase  64.89 
 
 
379 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.039065  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  64.86 
 
 
372 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  57.84 
 
 
376 aa  443  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  61.7 
 
 
376 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  63.71 
 
 
378 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  60.82 
 
 
390 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  62.97 
 
 
372 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  62.97 
 
 
372 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  61.89 
 
 
375 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  62.97 
 
 
372 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  62.7 
 
 
372 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  63.49 
 
 
380 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  60.33 
 
 
374 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  62.77 
 
 
374 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  57.99 
 
 
373 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  57.22 
 
 
376 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  57.22 
 
 
376 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  51.88 
 
 
373 aa  355  5e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  50.4 
 
 
373 aa  349  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0215  glutamate 5-kinase  67.19 
 
 
260 aa  342  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.256743 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  47.93 
 
 
372 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  47.18 
 
 
390 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  65.12 
 
 
260 aa  334  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  48.79 
 
 
376 aa  333  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1600  gamma-glutamyl kinase  49.05 
 
 
405 aa  330  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157762  hitchhiker  0.000100305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1783  glutamate 5-kinase  54.93 
 
 
383 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00674296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1460  glutamate 5-kinase  54.93 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
378 aa  325  6e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  47.58 
 
 
373 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  47.58 
 
 
387 aa  318  9e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  43.41 
 
 
373 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  47.53 
 
 
372 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  50.14 
 
 
383 aa  317  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
374 aa  315  6e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  45.78 
 
 
373 aa  315  7e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  48.48 
 
 
370 aa  315  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  46.7 
 
 
372 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  48.5 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1503  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 
373 aa  312  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  45.88 
 
 
372 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  48.12 
 
 
374 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 
372 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  48.79 
 
 
373 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 
372 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 
372 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 
372 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  46.99 
 
 
392 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  45.9 
 
 
376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1682  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  48.36 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  47.27 
 
 
367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>