More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4446 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
393 aa  783    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  91.28 
 
 
367 aa  670    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  62.71 
 
 
370 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2272  gamma-glutamyl kinase  67.67 
 
 
370 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918384 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  59.78 
 
 
363 aa  418  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  52.45 
 
 
369 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  51.22 
 
 
370 aa  360  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  52.19 
 
 
367 aa  358  6e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  52.19 
 
 
367 aa  358  6e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  52.19 
 
 
367 aa  358  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  52.19 
 
 
367 aa  358  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  52.19 
 
 
367 aa  358  6e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  52.19 
 
 
367 aa  358  6e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  52.19 
 
 
367 aa  358  6e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  52.19 
 
 
367 aa  358  6e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  52.19 
 
 
367 aa  358  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
372 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
372 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
372 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
372 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  52.04 
 
 
367 aa  358  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  51.09 
 
 
367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  51.09 
 
 
367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  51.09 
 
 
367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  51.09 
 
 
367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  51.35 
 
 
373 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  51.09 
 
 
367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  52.08 
 
 
367 aa  354  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  50.69 
 
 
372 aa  354  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  51.38 
 
 
369 aa  353  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  50.69 
 
 
372 aa  353  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
379 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 
373 aa  348  8e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  49.45 
 
 
373 aa  348  9e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  50.69 
 
 
374 aa  348  9e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  49.59 
 
 
372 aa  347  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  50.82 
 
 
379 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
379 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  51.23 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  51.23 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  51.1 
 
 
373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  51.23 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
373 aa  342  5e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  52.45 
 
 
367 aa  342  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  52.34 
 
 
372 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  51.23 
 
 
377 aa  338  8e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  51.24 
 
 
372 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  52.04 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  51.22 
 
 
372 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  51.22 
 
 
372 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  51.22 
 
 
372 aa  336  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  51.23 
 
 
367 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  50.95 
 
 
367 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  49.31 
 
 
370 aa  332  5e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  47.93 
 
 
373 aa  332  6e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
376 aa  329  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  46.01 
 
 
372 aa  328  7e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  49.45 
 
 
378 aa  328  9e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  51.52 
 
 
374 aa  326  5e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 
378 aa  326  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 
373 aa  325  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  48.14 
 
 
390 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  50.82 
 
 
372 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  48.64 
 
 
372 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  49.32 
 
 
373 aa  322  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  48.11 
 
 
372 aa  318  9e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 
372 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 
372 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 
372 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 
372 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 
372 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 
372 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 
372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  47.54 
 
 
367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  49.46 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  49.44 
 
 
373 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  48.07 
 
 
372 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  48.37 
 
 
372 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  43.28 
 
 
373 aa  311  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  47.83 
 
 
372 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  44.96 
 
 
371 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  49.16 
 
 
373 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  48.1 
 
 
372 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
374 aa  308  8e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  48.75 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  44.35 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  48.36 
 
 
374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  47.11 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  50.54 
 
 
374 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  49.46 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  47.22 
 
 
375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  46.58 
 
 
374 aa  301  9e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>