More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1121 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 372 aa  748    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  94.62 
 
 		 372 aa  721    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  94.62 
 
 		 372 aa  721    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  94.62 
 
 		 372 aa  721    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  95.97 
 
 		 372 aa  698    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  98.66 
 
 		 372 aa  741    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  84.68 
 
 		 374 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  98.66 
 
 		 372 aa  741    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  94.62 
 
 		 372 aa  721    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  84.68 
 
 		 372 aa  646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  86.38 
 
 		 369 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  98.92 
 
 		 372 aa  741    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  83.33 
 
 		 372 aa  627  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  83.06 
 
 		 379 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  81.72 
 
 		 372 aa  624  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  80.43 
 
 		 370 aa  610  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  64.01 
 
 		 369 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  64.48 
 
 		 377 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  65.19 
 
 		 379 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  64.36 
 
 		 379 aa  454  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  63.16 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  63.16 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  63.16 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  63.16 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  63.16 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  63.16 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  63.16 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  63.16 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  62.88 
 
 		 367 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  63.16 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  62.33 
 
 		 367 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  62.33 
 
 		 367 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  62.05 
 
 		 367 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  62.33 
 
 		 367 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  62.33 
 
 		 367 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  62.33 
 
 		 367 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  63.54 
 
 		 367 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  62.33 
 
 		 367 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  62.33 
 
 		 367 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  62.33 
 
 		 367 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  62.88 
 
 		 367 aa  434  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  62.88 
 
 		 367 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  63.16 
 
 		 367 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  57.58 
 
 		 370 aa  398  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  57.69 
 
 		 378 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  51.78 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  52.34 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  52.34 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  53.17 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  48.51 
 
 		 373 aa  342  5.999999999999999e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2272  gamma-glutamyl kinase  55.77 
 
 		 370 aa  342  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918384 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  47.99 
 
 		 373 aa  338  8e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  47.97 
 
 		 373 aa  333  3e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 		 373 aa  325  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  49.7 
 
 		 366 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  48.08 
 
 		 378 aa  318  7.999999999999999e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 		 376 aa  316  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  47.38 
 
 		 373 aa  315  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  44.78 
 
 		 373 aa  315  8e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  46.56 
 
 		 375 aa  312  6.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 		 374 aa  311  7.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  44.63 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 		 372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 		 372 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  44.78 
 
 		 376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  43.96 
 
 		 373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  43.56 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 		 368 aa  302  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  45.43 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  46.41 
 
 		 371 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  41.62 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  43.32 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  45.05 
 
 		 375 aa  300  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  46.98 
 
 		 374 aa  299  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 		 372 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  45.23 
 
 		 377 aa  295  9e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  43.92 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 		 374 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 		 375 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  44.23 
 
 		 373 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  42.82 
 
 		 383 aa  289  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 		 372 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 		 372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  46.65 
 
 		 373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 		 372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  46.65 
 
 		 373 aa  289  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  41.32 
 
 		 376 aa  289  6e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  44.72 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 		 372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  44.78 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  44.78 
 
 		 372 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>